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基因芯片實(shí)驗(yàn)外包

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  • 公司名稱 上海劍鈍生物科技有限公司
  • 品牌
  • 型號(hào)
  • 所在地 上海市
  • 廠商性質(zhì) 經(jīng)銷商
  • 更新時(shí)間 2017/9/29 9:32:34
  • 訪問次數(shù) 795

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基因芯片實(shí)驗(yàn)外包
基因芯片的測(cè)序原理是雜交測(cè)序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進(jìn)行核酸序列測(cè)定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探針。

詳細(xì)信息 在線詢價(jià)

基因芯片實(shí)驗(yàn)外包原理

  利用雜交的原理,即DNA根據(jù)堿基配對(duì)原則,在常溫下和中性條件下形成雙鏈DNA分子,但在高溫、堿性或有機(jī)溶劑等條件下,雙螺旋之間的氫鍵斷裂,雙螺旋解開,形成單鏈分子(稱為DNA變性,DNA變性時(shí)的溫度稱Tm值)。變性的DNA黏度下降,沉降速度增加,浮力上升,紫外吸收增加。當(dāng)消除變性條件后,變性DNA兩條互補(bǔ)鏈可以重新結(jié)合,恢復(fù)原來的雙螺旋結(jié)構(gòu),這一過程稱為復(fù)性。復(fù)性后的DNA,其理化性質(zhì)能得到恢復(fù)。

利用DNA這一重要理化特性,將兩個(gè)以上不同來源的多核苷酸鏈之間由于互補(bǔ)性而使它們?cè)趶?fù)性過程中形成異源雜合分子的過程稱為雜交(hydridization)。雜交體中的分子不是來自同一個(gè)二聚體分子。由于溫度比其他變性方法更容易控制,當(dāng)雙鏈的核酸在高于其變性溫度(Tm值)時(shí),解螺旋成單鏈分子;當(dāng)溫度降到低于Tm值時(shí),單鏈分子根據(jù)堿基的配對(duì)原則再度復(fù)性成雙鏈分子。因此通常利用溫度的變化使DNA在變性和復(fù)性的過程中進(jìn)行核酸雜交。

 

基因芯片實(shí)驗(yàn)外包數(shù)據(jù)分析(以miRNA芯片分析為例)

標(biāo)準(zhǔn)分析

芯片預(yù)處理與標(biāo)準(zhǔn)化;

篩選差異表達(dá)microRNA;

microRNA聚類圖、火山圖以及熱圖等;

microRNA靶基因預(yù)測(cè),基于多數(shù)據(jù)庫(kù)整合的靶基因預(yù)測(cè)以及上海豐核自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的預(yù)測(cè)軟件同時(shí)識(shí)別;

對(duì)預(yù)測(cè)的microRNA的靶基因進(jìn)行GO富集分析通路富集分析等。

個(gè)性化分析

1.microRNA網(wǎng)絡(luò)分析:microRNA靶基因失調(diào)網(wǎng)絡(luò);microNRA功能協(xié)同作用網(wǎng)絡(luò)。

2.microRNA與其他芯片整合分析:與lncRNAs芯片結(jié)果聯(lián)合分析(ceRNA Analysis);與mRNA芯片整合分析;與DNA甲基化芯片結(jié)果聯(lián)合分析。

3.與臨床數(shù)據(jù)整合分析

基因芯片實(shí)驗(yàn)外包


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